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但使用化肥僅僅幾十年的時間就暴露出它難以克服的弊端，不僅對土地資源破壞很大，而且污染土壤，使土壤板結，造成土壤肥力下降，農產品品質降低等一系列問題。隨著人民生活水平的不斷提高，尤其是人們對生活質量提高的要求，國內外都在積極發展綠色農業來生產安全、無公害的綠色食品。生產綠色食品過程中要求不用或盡量少用化學肥料、化學農藥和其它化學物質。生物肥料被認為是一個重要的解決方案。生物肥料的重要性，就在于保證糧食安全的長期性。

由單純的菌劑向生物菌劑與營養元素、有機肥、抗生素等的復合生物肥轉化。這種轉化能夠實現生物肥料與藥劑的結合，增強肥料的多功能作用。同時劑型由單一向多元化轉化，為適應不同的條件，生物肥料可分為液體劑型、草炭載體的粉劑，顆粒劑型、凍干劑型、礦油封面劑型等劑型。

生物肥料必將在微生物種群繁殖生長的同時向作物根際分泌一些此生代謝產物，而其中的一些此生代謝產物具有改善植物營養、刺激生長和抑制病菌等綜合功能。許多微生物的功能也不是單一的，因此生物肥料將向功效的多樣性發展，除要求應有的肥效外，還應開發兼有防治土傳病害作用的生物肥料。

通過篩選高效快速降解農田有機污染物、土壤修復、克服作物連作障礙和秸稈快速腐解的優良菌株，優化生產工藝，縮短培養時間，提高單位產品的菌含量和功能活性，研究和應用保護劑、膜技術材料和工藝，針對環境污染和作物連作障礙等問題，采用生物肥料和種業結合、生物肥料與施肥結合、生物肥料與土壤修復結合等措施，研制高效、抗逆、保質期長、安全的土壤功能修復及克服連作障礙的生物肥料新產品是生物肥料產業的發展重點和方向。

生物肥料的功效是一種綜合作用，主要是與營養元素的來源和有效性有關，或與作物吸收營養、水分和抗病（蟲）有關。生物肥施人土壤后，生物菌能很快繁殖，形成群體優勢，分解土壤中被固定的和不可利用的氮、磷、鉀，固定空氣中的游離氮，供作物吸收利用。生物活性菌與有機質、無機營養相結合，不僅可以調節作物根系土壤微生物的生態環境，還可以增加土壤中有益微生物的種群和數量。

目前，世界上至少有100多個國家擁有自己的微生物肥料生產企業、產品技術標準和質量監督體系，根瘤菌劑、溶磷生物肥料、解鉀生物肥料和微生物土壤調理肥料等應用較普遍。在歐美發達國家農業生產中，生物肥料的使用占肥料總量的20%以上，其中美國、英國生物肥料占肥料總量的比例最高。

據不完全統計，全世界生物肥料注冊企業15000多個，注冊的生物肥料產品有45000多個，多數國家的生物肥類型在10種左右。據粗略估算，全世界近150個國家生物肥料年總產量達到1億噸。

相關數據顯示，目前全國從事各類新型肥料生產的企業已超過2000家，占全國肥料生產企業總數1/4。新型肥料產業資產規模約為500億元，新型肥料產業的總產出每年約為164億元。

夯實根基，積累實力，是其發展方向；面對地域、面向現實，采取多樣化發展策略，是其有效途徑。市場、政府雙輪驅動是其起步階段的必要措施。特別是在廣大西部的不發達農牧區更是如此。傳統農區的技術改造，任重道遠。是為記。