一、可以使養分供應更全面持久化肥的特點是養分含量高，肥效快但持續時間短，養分單一；農家肥大多養分種類豐富，但含量低、肥效慢而持續時間長。因此，將化肥與農家肥混合施用可以取長補短。 二、可以減少養分被固定，提高肥效化肥尤其是磷肥施入土壤后容易被土壤固定，從而降低了養分的有效性。若與農家肥混施，可以減少化肥與土壤的接觸面，從而減少被土壤固定的機會，提高肥效。
三、可以保蓄養分，減少流失化肥溶解度大，施用后對土壤造成較高的滲透壓，影響作物對養分和水的吸收，增加了養分流失的機會。如與農家肥混合施用，就可以改善作物對養分的吸收，減少養分損失。 四、可以調節土壤酸堿度，改良土壤結構農家肥可以提高土壤的緩沖能力，調節酸堿度，使土壤酸性不至于過高。 五、可以促進微生物活動，增加土壤養分，提高土壤活力農家肥是微生物生活的原料，化肥供給微生物生長發育的無機營養。化肥與農家肥混用能促進土壤中微生物的活動，進而促進有機肥的分解，增加土壤養分，同時還會使土壤有機質不斷更新，改善土壤理化性質。
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